乙肝表面抗原阴性不能排除乙肝病毒感染已经成为共识，尤其是在乙肝病毒感染的高发地区。我国人群乙肝病毒感染率较高，是隐匿感染存在的基础。
隐匿性乙肝病毒感染的发生是病毒和机体相互作用的结果，可能有多种机制。(１)乙肝病毒低水平复制，抗原表达量低。(２)乙肝病毒基因变异。(３)乙肝病毒整合到宿主染色体中：(４)外周血单核细胞感染乙肝病毒。(５)宿主免疫应答异常。(６)受其他病毒感染的干扰。(７)试剂的灵敏度和质量问题。
隐匿性乙肝病毒感染普遍存在，其意义有下面几个方面。(１)是输血、血液透析以及脏器移植传播乙肝病毒的潜在危险。(２)是隐源性肝病的病因。(３)隐匿性乙肝病毒感染病毒恶化已有诸多报道，但发生频率尚不清楚。(４)在肝细胞癌病人中常常发现隐匿性乙肝病毒感染的存在，认为与原发性肝癌发生有关，尤其是合并丙肝病毒感染时。(５)当丙肝病毒感染合并隐匿性乙肝病毒感染时，将会影响其自然病程或增加疾病的严重程度。(６)是乙肝疫苗接种无应答的原因之一。此外乙肝病毒隐匿性感染者是乙肝病毒母婴传播途径的重要传染源。